Søren K. Hansen har gennem de sidste 20 år været fast dirigent for Vokalensemblet GAIA, der er kendt som et af de bedste kor i Danmark. Han er desuden fast dirigent for Århus Sinfonietta og ansat som docent i kor- og ensembleledelse ved Det Jyske Musikkonservatorium. Foruden DR VokalEnsemblet har han i forbindelse med sit freelancearbejde blandt andet dirigeret de danske landsdelsorkestre, Ensemble 2000, Ars Nova Copenhagen, Pro Coro Canada, DR KoncertKoret og det svenske Radiokor. Han har været kunstnerisk leder af Den Jyske Operas kor siden 2003, og som operadirigent har han ofte beskæftiget sig med det ældre, sjældent hørte repertoire eller det helt nyskrevne. På Den Jyske Opera har han stået for flere opførelser af ny musikdramatik. Inden for det klassiske operarepertoire har han dirigeret opsætninger af blandt andet Monteverdis Poppeas kroning og Saint-Saëns' Samson og Dalila.